Via deze link leest u het gehele nieuwsbericht op onze LinkedIn pagina: Sequencing Tim
Met een apparaatje ter grootte van een smartphone kunnen wij binnenkort grote stukken genetisch materiaal, of zelfs het hele pakket, van een ziekteverwekker in kaart brengen. Deze techniek – het zogenoemde ‘third generation sequencing’ – gaan we als RLM vanaf 2026 in bepaalde situaties inzetten bij onze diagnostiek. We gebruiken hiervoor de MinION van Oxford Nanopore. Dit draagbare device kan lange reeksen DNA of RNA, de unieke erfelijke code van individuele organismen, snel lezen. Zo kunnen we micro-organismen extreem nauwkeurig identificeren. Sequencing betekent letterlijk ‘volgorde bepalen’, in dit geval de volgorde van basen, de bouwstenen van DNA.
Deze vorm van moleculaire diagnostiek lijkt op de PCR-test die we dagelijks gebruiken, maar is zowel uitgebreider als verfijnder, legt onze medisch-moleculair microbioloog Tim Schuurman uit. “Bij de PCR-test vergelijken we materiaal dat bij de patiënt is afgenomen met een stukje bekend DNA of RNA van een bacterie of virus. Daarbij moeten we vooraf bedenken welke ziekteverwekker de veroorzaker kan zijn. Als we niet goed weten waar we naar zoeken, kan het zijn dat we niet de juiste PCR-test inzetten. Met sequencing daarentegen kun je direct de genetische code van de boosdoener uitlezen. Gevonden reeksen vergelijken we met databases of met andere gevonden reeksen. We kunnen dus breder zoeken en we krijgen meer gedetailleerde informatie.” lees verder: Sequencing Tim